地方州郡制度为州、郡、县三级，南渡前共有司、豫、兖、青、徐、冀、幽、平、并、雍、秦、凉、荆、扬、益、梁、交、广、宁，十九州。
南渡后分荆、扬置江、湘二州，共有扬、荆、湘、江、益、梁、宁、交、广九州，徐州仅存其半。
南渡前，以司隶校尉领司州，其余十八州置州牧，均为第二品。
州牧皆铜印墨绶，进贤两梁冠，绛朝服，三年一入朝奏事。
若有都督，则都督知军事，州牧治民。
州府僚佐自别驾从事以下，由州牧辟用当地人士，将军府僚佐皆为中央除授。
【州府僚佐】
别驾、治中：州之上佐，别驾从州牧行部，治中居中治事，主众曹文书。
官品视第五。
主簿：录阁下众事，省署文书。
西曹书佐：辅佐别驾主吏及选举事。
治中从事史：主财谷簿书。
兵曹从事史：有军事则置，主典兵马事。
部郡国从事史：督促文书，举察非法。
典郡书佐：典一郡文书，以郡吏补。
三师：孝经师主监试，月令师主时节祭祀，律令师主平法律。
门亭长：主州之正门。
【将军府僚佐】
长史、司马、录事参军、功曹参军、仓曹参军、户曹参军、中兵参军、府功曹、主簿
州下设郡（封国与郡同级），郡设郡守，总领郡中诸事，第四品，有治绩则入为京官。
郡都尉第五品，典兵禁，备盗贼。
郡丞为郡守副佐，第六品。
功曹吏主选举黜陟，五官掾主诸曹事。
郡下有县，大县置令，小县置长，下置县尉为佐。
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